環境構築を追試してみたので，補足というかやってみたメモを残しておきます．

1.eclipseはEclipse IDE for C/C++ Developersをダウンロード．CDT(C/C++ Developers Tool)の更新ために[ヘルプ]→[更新の確認]でCDTを最新のものに更新する．C/C++ GDB Hardware debuggingは[ヘルプ]→[新規ソフトウェアのインストール]から検索してインストール．

2.Atollic TrueSTUDIOからgdb serverを取り出すのに，古い(3.1.0)がなくなっていた(2012-12-12現在)ので，fenrirさんからgdb serverを頂いた．

3.以降は書いてある通りに出来ました．

デバッグ後はフラッシュに書き込まれているので，リセットボタンを押せばマイコンの中身が更新されました．

以上，自分がひっかかったところのメモでした．